骨骼肌手术性损伤后的肌核动态变化 2026年5月14日 0 121 细胞生物学 受损骨骼肌纤维的一个标志性特征是肌核发生移位，不再位于周边位置。传统观点教条式地认为，移位的肌核完全来源于肌肉干细胞（卫星细胞）的融合。采用手术切除性肌损伤模型以及体内非重组依赖性的驻留肌核标记方法，我们详细描述了在非化学介导的肌肉创伤应答中，移位肌核的发生率、时间进程及其来源。 我们发现：1）在手术损伤后7天，来源于非卫星细胞的（驻留性）移位肌核在完整肌纤维中出现，其比例与外源性（卫... 卫星细胞 肌核移位 肌纤维修复 肌肉再生 骨骼肌损伤 阅读更多
动态分子特征的内在协调塑造人类前额叶皮层 2026年5月14日 0 115 神经科学 大脑皮层通过离散皮层区域的协同活动驱动人类认知，而每个区域都具有特异的分子、结构和功能特征。这一组织的核心是前额叶皮层（PFC），其作为执行功能的枢纽，在人类中表现出不成比例的扩张，并对神经发育障碍表现出选择性易感性。既往研究已鉴定出一组前额叶皮层富集的标志基因，这些基因具有动态的表达轨迹；对这些数据集的再分析进一步将这些标志基因整合为18种不同的、表征前额叶皮层时空身份的分子特征。然而... CRISPR激活筛选 YBX1 前额叶皮层 皮层发育 类器官 转录因子 阅读更多
时间转录组学揭示人类诱导多能干细胞中多个长链非编码RNA对特定异构体的反式调控 2026年5月14日 0 106 分子生物学 一些长链非编码RNA（lncRNA）已知能够调控基因表达。然而，lncRNA影响基因与表观遗传调控的潜在时间动态，以及lncRNA在反式调控中的作用机制，仍然知之甚少。为研究这一问题，我们在人体多能干细胞（hiPSC）中，于H11安全港位点通过基因工程构建了17个可被多西环素诱导的lncRNA转基因，以实现异位表达，并获得了高密度时间分辨率的RNA-seq和ATAC-seq图谱。大多数... ATAC-seq RNA-seq 反式调控 时间转录组学 诱导多能干细胞 长链非编码RNA 阅读更多
TSST 1结构基序破坏了血管再生所必需的内皮程序。 2026年5月14日 0 115 细胞生物学 金黄色葡萄球菌在感染过程中会造成严重的血管损伤，可在多个器官中引发血管损害，并形成难以愈合的病灶。超抗原是金黄色葡萄球菌感染中的主要毒力因子，然而其对血管修复的直接影响仍不明确。我们提供了证据表明，TSST-1通过协同机制破坏内皮再生。TSST-1干扰定向集体迁移，损害内皮细胞方向持续性，并阻止体外再内皮化。这些缺陷源于细胞骨架紊乱，其特征为应力纤维积聚和片状伪足丧失，以及与细胞运动性... TSST-1 内皮再生 细胞骨架 蛋白质组学 血管生成 金黄色葡萄球菌 阅读更多
原核生物ClpP/ClpR介导的组蛋白质量控制调控疟原虫真核有丝分裂细胞周期 2026年5月14日 0 108 细胞生物学 在恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）中，于红细胞内裂殖生殖过程中，DNA复制和不同步细胞核的形成先于胞质分裂发生。脂肪酸（fatty acids, FAs）摄取受抑以及膜生物发生受损，会通过抑制DNA复制和细胞核形成而导致有丝分裂停滞。在感染红细胞（iRBC）表面，寄生虫核糖体蛋白P2（PfP2）复合物介导脂肪酸摄取和膜生物发生，这些过程似乎是DNA复制和细胞核形... ClpP/ClpR 有丝分裂检查点 疟原虫 组蛋白降解 细胞周期调控 脂肪酸代谢 阅读更多
时长序列依赖的神经基础：基底神经节与后内侧皮层中的相反调制 2026年5月14日 0 107 神经科学 知觉判断会系统性地偏向近期经验，这一现象被称为序列依赖。该效应在时间知觉中的脑回路基础仍不清楚。借助功能性磁共振成像（fMRI），我们识别了时长序列依赖的神经基础，并检验其是否与运动方向的神经基础重叠。27名参与者复现视觉刺激的时长或方向；刺激呈现后3秒，通过一个回溯线索揭示需要报告的特征，从而将记忆痕迹信号与任务切换信号分离开来。时长序列依赖表现稳健，且在任务重复试次中的强度约为任务切... 任务切换 功能磁共振成像 后扣带皮层 基底神经节 序列依赖 时间知觉 阅读更多
利用扭曲扩散进行机械生物分子结构预测的贝叶斯引导方法 2026年5月14日 0 124 计算生物学 深度学习方法彻底改变了蛋白质结构预测。这些工具利用实验数据进行训练，能够重现已报道的构象，但人们对预测那些虽具有功能相关性却在实验中代表性不足的构象抱有浓厚兴趣。由于许多现代结构预测工具使用生成式人工智能扩散模型，我们将对替代性分子构象的搜索重新表述为：从一个利用任意贝叶斯似然进行条件化的扩散分布中进行采样。 我们在 Boltz-2 中实现了一种扭曲扩散采样器，以对该条件分布进行采样，... 分子构象采样 扩散模型 机械生物分子 蛋白质结构预测 贝叶斯引导 阅读更多
迭代结构同源性搜索鉴定出蛋白质 O-岩藻糖基转移酶 POFUT3 和 POFUT4 的新底物 2026年5月14日 0 113 生物化学 作者声明不存在任何竞争性利益。 感谢您有兴趣传播有关 bioRxiv 的信息。 📄 原文链接： https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.724420v1?rss=1 🏷️ 蛋白质糖基化 O-岩藻糖基转移酶 底物鉴定 结构同源性搜索 POFUT3/POFUT4... O-岩藻糖基转移酶 POFUT3/POFUT4 底物鉴定 结构同源性搜索 蛋白质糖基化 阅读更多
体外和体内低分割照射后乳腺癌细胞持久应激反应的比较分析 2026年5月14日 0 95 医学 放射治疗（radiotherapy，RT）的抗癌疗效受获得性放射抗性（radioresistance，RR）的限制。本研究旨在表征乳腺癌细胞对大分割照射（hypofractionated irradiation，hFI）的长期应答。为此，我们采用一种具有临床导向的 hFI 方案（累积剂量 56 Gy）对小鼠乳腺 4T1 肿瘤细胞（4T1WT）进行处理，以在体外筛选获得放射抗性细胞（4T1RS... DNA损伤应答 乳腺癌 低分割放疗 双链断裂修复 放射抗性 阅读更多
形态学指纹使基于机器学习的方法能够在无需转录组学的情况下推断神经母细胞瘤细胞状态 2026年5月14日 0 102 计算生物学 癌细胞状态的推断对于理解致癌机制和预测临床结局至关重要，然而，目前对转录组分析的依赖限制了其可扩展性和实时监测能力。在此，我们表明，细胞形态能够提供一种低维、可观测的细胞身份及其动态变化表征。以神经母细胞瘤（NB）为模型系统，我们建立了一种机器学习—形态学表型分析框架，无需依赖转录组测量，即可直接从高维形态学指纹中推断肾上腺能型（ADRN）和间充质型（MES）细胞状态。通过与单细胞RN... 单细胞RNA测序 机器学习 神经母细胞瘤 细胞形态学 细胞状态推断 表型可塑性 阅读更多
dsRADAR：通过重新利用RNA结合蛋白对细胞双链RNA进行成像与定量 2026年5月14日 0 104 分子生物学 双链RNA（dsRNA）可被细胞受体识别为病毒感染的标志，从而触发先天性免疫反应。越来越多的证据表明，细胞失调——例如免疫性疾病和神经退行性疾病中的异常——也会导致内源性产生的dsRNA积累，并激发一种类病毒的免疫反应。此外，RNA治疗制剂中的dsRNA污染也可通过类似途径引发有害副作用。尽管dsRNA具有重要的临床相关性，但其可靠的检测工具仍然有限。目前，dsRNA检测几乎完全依赖单... ADAR3 RNA结合蛋白 先天免疫 分子成像 双链RNA 检测探针 阅读更多
变动流体力学解释了为什么静态效力测试会高估消毒剂对李斯特菌的性能 2026年5月14日 0 155 微生物学 食品生产过程中的病原体交叉污染主要通过环境卫生控制。然而，消毒剂效力通常是在台架尺度实验中进行研究的，这类实验对消毒过程中的流体动力学模拟较差，从而限制了我们对商业化消毒效果的理解。本研究将计算流体力学（CFD）对剪切应力的估算与实验测量相结合，评估了100 ppm次氯酸盐消毒剂处理后不锈钢表面上无害李斯特菌（Listeria innocua）的减少情况。 在中试尺度下，由研究人员手动施... 剪切应力 李斯特菌 消毒剂效力 计算流体力学 食品卫生 阅读更多