脂质体相制备的可持续技术 May 13, 2026 0 159 药理学 脂质体是由脂质自组装形成的囊泡,能够包封亲水性和疏水性治疗剂,因此成为药物递送和生物医学技术中的多功能平台。在本研究中,研究者对经典薄膜水化法的局限性进行了严格评估,并建立了一种可持续且经过系统优化的策略,用于生成明确的脂质体层状相。研究对水化条件进行了优化,确定每10 mg脂质加入4 mL缓冲液为最佳条件,可实现有效复水并提高囊泡测量的统计可靠性。 经改进的探针超声方案(振幅20%,5 ... 机器学习表征 脂质体制备 药物递送 薄膜水化法 超声优化 Read more
通过水热法和微波辅助法利用熊果提取物绿色合成荧光碳量子点:理化性质比较表征、抗氧化活性及生物相容性评价 May 13, 2026 0 93 生物化学 具有可调表面化学性质和明确生物活性的光致发光纳米材料的可持续合成,仍然是绿色纳米科学中的核心挑战。本文表明,在对单一熊果提取物前驱体体系进行碳化时,所采用的能量输入路径会对所得碳量子点(CQDs)的表面化学、光学性能和生物活性产生决定性且机制一致的影响。水热处理(160°C,6 h)可得到水动力学直径为 7.13 nm 的颗粒,其表面富含羟基和羰基官能团,具有更高比例的石墨化碳(43.0... 微波辅助法 抗氧化活性 水热法 生物相容性 碳量子点 绿色合成 Read more
使用对比解码重新设计选择性蛋白质结合物 May 13, 2026 0 136 计算生物学 动机:固定骨架序列设计方法,如 ProteinMPNN,仅基于骨架坐标进行操作,无法表征结合界面处目标分子的侧链。其解码算法也缺乏一种能够平衡结合亲和力与折叠稳定性,或提高对结构相似脱靶对象选择性的机制。这些缺陷限制了高亲和力和高特异性蛋白质结合体的计算设计。 结果:我们提出了 RedNet,这是一种能够编码结合靶标侧链信息的多尺度图神经网络。我们进一步开发了一种对比解码算法,其灵感来... 图神经网络 对比解码 蛋白质界面 蛋白质设计 计算建模 选择性结合 Read more
耻垢分枝杆菌中多功能 Spns 药物外排泵的质子偶联交替通路机制 May 13, 2026 0 142 生物化学 Spns 转运体属于主要易化子超家族蛋白,调控脂质转运、溶酶体稳态、免疫以及疾病过程,然而质子化如何使其能够执行化学性质多样的转运功能仍不清楚。在此,我们将脂质纳米盘中的双电子-电子共振光谱技术与 DEER 和 AlphaFold 引导的建模相结合,以界定……的构象图谱 作者声明不存在竞争性利益关系。 感谢您有兴趣传播有关 bioRxiv 的信息。 📄 原文链接: https://www... Spns转运体 交替通路机制 分枝杆菌 药物外排泵 质子偶联 Read more
整合RNA测序分析鉴定出介导红豆杉属物种中紫杉烷外排的ABC转运蛋白 May 13, 2026 0 112 植物学 来自药用红豆杉的RNA-seq数据集对于研究紫杉醇生物合成至关重要。然而,显著的批次效应阻碍了跨研究数据分析。在此,我们汇编了来自三项研究、涵盖四种组织(树皮、叶、根、茎)的45个RNA-seq样本,并评估了35种预处理流程,这些流程结合了六种归一化策略和五种批次效应校正方法。采用无监督聚类方法(HCA、k-means、Grade-of-Membership),并使用Jaccard指数和调... ABC转运蛋白 RNA测序整合分析 分子对接 批次效应校正 紫杉醇生物合成 红豆杉属 Read more
没有异源三聚体驱动蛋白的生命:锥虫类寄生虫利用同源二聚体驱动蛋白-2马达的组合来驱动鞭毛内运输 May 13, 2026 0 142 细胞生物学 异源三聚体驱动蛋白2是顺向鞭毛内运输(IFT)的经典马达蛋白,驱动蛋白复合体向纤毛和鞭毛尖端移动。在此,我们表明,眼虫总门(Euglenozoa)的所有成员均缺失异源三聚体驱动蛋白基因,取而代之的是拥有数量可变的两类同源二聚体驱动蛋白基因,分别命名为KIN2A和KIN2B。当在体外表达时,布氏锥虫(Trypanosoma brucei)的这两种驱动蛋白均形成同源二聚体,并沿脑微管进行过... 同源二聚体马达 锥虫类寄生虫 鞭毛内运输 鞭毛组装 驱动蛋白-2 Read more
cran2crux:自动为 R 软件包创建 CRUX 移植包 May 13, 2026 0 169 生物信息学 研究动机:R 连同 CRAN 和 Bioconductor 构成了生物信息学与计算生物学领域最丰富的生态系统之一,拥有数以千计的专用软件包。尽管 GNU/Linux 是该领域中广泛使用的操作系统,但 R 软件包通常独立于系统原生的软件包管理器进行管理。这种分离使得安装、更新和大规模重建变得繁琐。CRUX 是一个极简的半源码 GNU/Linux 发行版,凭借其基于 ports 的系统,为... Bioconductor CRAN Linux包管理 R软件包 依赖解析 自动化工具 Read more
HAIRpred2:利用混合物理化学与结构特征进行人类宿主特异性抗体相互作用残基预测 May 13, 2026 0 168 生物信息学 构象性B细胞表位的预测对于疫苗设计、免疫治疗和抗体工程至关重要。迄今为止,已开发出若干与宿主无关的计算方法,用于预测抗原结构中与抗体相互作用的残基。然而,已有充分证据表明,抗原-抗体(Ag-Ab)相互作用会因宿主免疫系统的不同而发生变化,这表明开发宿主特异性预测模型具有重要意义。在本研究中,我们首次提出了一种人类宿主特异性方法HAIRpred2,可根据抗原的三级结构预测其中与抗体相互作... B细胞表位预测 宿主特异性 抗原抗体相互作用 机器学习 理化特征 结构生物信息学 Read more
拟南芥中莽草酸途径分支点化合物分子——分支酸与异分支酸的周转揭示芳香族代谢的隐性动态 May 13, 2026 0 162 植物学 莽草酸途径为植物初生代谢和次生代谢中的酚类代谢物提供前体。利用一种新型同位素异构体 MS/MS 方法,对完整拟南芥叶片中的碳通量进行测定,揭示了分枝酸与异分枝酸库之间出人意料的动态关系。13CO2 标记动力学表明,来源于叶绿体的莽草酸是一个主要的分流点,其中约三分之一从叶绿体转运出去。相比之下,分枝酸的小型代谢库主要定位于叶绿体内,并且周转迅速,在数分钟内标记率即超过 70%。 异分枝酸作... 分枝酸 同位素示踪 异分枝酸 拟南芥 水杨酸代谢 莽草酸途径 Read more
儿童与成人运动序列学习:脑激活时间进程与表征稳定性的年龄差异 May 13, 2026 0 185 神经科学 人类具备一种惊人的能力,能够在有限的练习后习得复杂的动作序列。动作序列学习涉及由多个脑区构成的分布式网络,这些脑区表现出不同的学习相关变化:前额叶皮层(PFC)主要在学习早期参与,而初级运动皮层(M1)则在学习后期越来越多地参与。由于在个体发育过程中,运动相关脑区的成熟相对早于PFC,我们考察了儿童与成人在支撑动作序列学习的神经变化时间进程上存在何种差异。 通过使用功能性磁共振成像(fM... 初级运动皮层 前额叶皮层 功能磁共振成像 多变量模式稳定性 脑发育 运动序列学习 Read more
mTOR功能获得性Smith-Kingsmore综合征(SKS)与TSC2缺陷中的分化信号传导谱 May 13, 2026 0 116 分子生物学 Smith-Kingsmore 综合征(SKS)是一种罕见的神经发育障碍,由功能获得性突变引起。 📄 原文链接: https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.09.724025v1?rss=1 🏷️ mTOR信号通路 Smith-Kingsmore综合征 TSC2缺陷 功能获得性突变 神经发育障碍... Smith-Kingsmore综合征 TSC2缺陷 mTOR信号通路 功能获得性突变 神经发育障碍 Read more
构建三维肺共培养平台以模拟肺纤维化中上皮细胞—成纤维细胞相互作用 May 13, 2026 0 185 细胞生物学 特发性肺纤维化(IPF)是一种致命性的间质性肺疾病(ILD),其特征为进行性纤维化、肺弹性不可逆丧失以及慢性呼吸衰竭,平均生存期为3–5年。一般认为,该疾病源于反复发生的肺泡上皮损伤,这种损伤持续激活转化生长因子-β(TGF-β)信号通路,从而驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞分化并导致过度的胶原沉积。尽管现有的IPF模型,包括动物研究、二维培养以及基础三维系统,增进了对疾病机制的理解,但它... TGF-β信号 三维共培养 上皮-成纤维细胞互作 细胞外基质重塑 肺纤维化 Read more