Au_Sus:人类自噬基因的分层共识普查

自噬是一种关键的细胞过程,然而其基因组学定义在各类数字资源库中仍不一致。这种标准化的缺失阻碍了高通量研究和临床研究中的可重复性。在此,我们提出 Au_Sus,这是一个通过对七个主要数据库和文献来源进行基于频率的多数共识而建立的高置信度人类自噬基因全集。在经过严格的人工整理和命名标准化后,我们定义了一个分层框架:Maxim_Au(2,581 个基因)、Au_Sus(由 201 个基因组成的核心共识)...
生物信息学

自噬是一种关键的细胞过程,然而其基因组学定义在各类数字资源库中仍不一致。这种标准化的缺失阻碍了高通量研究和临床研究中的可重复性。在此,我们提出 Au_Sus,这是一个通过对七个主要数据库和文献来源进行基于频率的多数共识而建立的高置信度人类自噬基因全集。在经过严格的人工整理和命名标准化后,我们定义了一个分层框架:Maxim_Au(2,581 个基因)、Au_Sus(由 201 个基因组成的核心共识)以及 Minim_Au(77 个通用基因)。

功能富集和蛋白质-蛋白质相互作用分析证实,Au_Sus 捕捉到了一个高度整合且高度纯化的自噬机制,并与神经退行性疾病和肿瘤学显著相关。此外,对近 100 个已发表的癌症基因特征的分析显示出明显的功能稀释现象,其中 60% 的特征基因未包含在我们的共识中。这些发现表明,许多此类模型纳入的是外围应激标志物,而非核心自噬效应因子。因此,Au_Sus(可于 ausis.uniovi.es 免费获取)为健康与疾病中自噬研究的标准化提供了一个可靠、可直接使用的基准。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.724962v1?rss=1

🏷️ 自噬 基因全集 共识数据库 功能富集分析 蛋白互作网络

Administrator 2026年5月17日
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