生物信息学
城市农业日益依赖基于堆肥的基质以实现可持续生产，然而，对于这类系统如何响应旨在引入有益微生物群的生物修饰剂，我们仍缺乏清晰的表征。在本研究中，我们考察了发育阶段以及丛枝菌根真菌（AMF）与解磷细菌（PSB）共接种如何重塑生长于城市农场堆肥基质中的番茄（Solanum lycopersicum）根际微生物功能。
通过植物生理测定、16S rRNA扩增子测序以及基于宏基因组信息的宏蛋白质组学，我们表征了在开花期和结果期、对照组、单独接种AMF组、单独接种PSB组以及AMF与PSB共接种组条件下，番茄的生理响应和根际微生物活性。共接种协同富集了有益类群，改善了果实养分积累，提高了营养转运蛋白和群体感应蛋白的产量，并在竞争中被排斥的类群中驱动了由胁迫诱导的休眠，且这些响应在不同发育阶段之间存在差异。
我们的研究结果确立了基于宏基因组信息的宏蛋白质组学对于解析番茄发育过程以及AMF与PSB共接种所引发的根际微生物组阶段特异性功能响应的重要性。
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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.12.724390v1?rss=1
🏷️ 宏蛋白质组学 根际微生物组 AMF-PSB共接种 番茄 发育阶段 堆肥基质