植物生长促进微生物通过影响宿主营养可利用性，或通过释放负责调控激素串扰的次级代谢产物，来促进宿主的发育进程。新近鉴定的放线菌门产铵菌 Microbacterium bengalense sp. nov. GB16_1_BI（登录号：SRX9280401）可通过调控根际细菌促进植物生长。对黑米（Chakhao Poireiton）根际16S rRNA V3-V4区的扩增子测序表明，GB16_1_BI可抑制大多数细菌。然而，GB16_1_BI接种促进了水淹稻田根际特有稀有细菌的生长。
采用PICRUSt2（基于未观测状态重建的系统发育群落解析）对OTU进行分析显示，氮循环标志基因（nifH、nrfA和nrt）的丰度升高，而nifD或nifK并未升高；这一结果也在固氮细菌OTU的ANOSIM分析中得到体现。甲烷代谢标志基因（comA、comB、cofG和cofH）在接种植株中也高于对照；然而，ANOSIM研究并未在甲烷循环细菌的OTU中支持这一观察结果。Methylosinus和Methylocystis这两类最丰富的甲烷氧化菌OTU也被认为具有固氮能力。
因此，GB16_1_BI可能主要通过调控氮循环微生物来影响植物生长。对GB16_1_BI的基因组测序以及非靶向代谢组分析表明，其富含可能具有抗菌活性的次级代谢产物。GB16_1_BI可利用多种碳水化合物和氨基酸作为能量来源，并形成持留样细胞，这可能有助于其在缺乏宿主植物时于土壤中存活。
作者声明不存在任何竞争性利益。
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🏷️ 根际微生物组 植物生长促进菌 Microbacterium 氮循环 甲烷代谢