安第斯病毒測序準備的方法學評估與數據資源

摘要 作為支援英國高後果傳染病(HCID)框架下分類病原體相關準備工作的一部分,我們此前評估了兩種用於安第斯病毒(ANDV)測序的方法:一種是全基因組平鋪式擴增子測序方案,另一種是泛病毒雜交捕獲方法(TWIST-CVRP)。 鑑於近期暴發事件,我們現公開使用歷史性ANDV分離株(智利,1997年)生成的病毒測序數據集。此外,我們還提供了對平鋪式擴增子方案性能的評估,並基於與近期發佈的暴發株基因...
生物資訊學

摘要

作為支援英國高後果傳染病(HCID)框架下分類病原體相關準備工作的一部分,我們此前評估了兩種用於安第斯病毒(ANDV)測序的方法:一種是全基因組平鋪式擴增子測序方案,另一種是泛病毒雜交捕獲方法(TWIST-CVRP)。

鑑於近期暴發事件,我們現公開使用歷史性ANDV分離株(智利,1997年)生成的病毒測序數據集。此外,我們還提供了對平鋪式擴增子方案性能的評估,並基於與近期發佈的暴發株基因組的計算機模擬比較,提出了推薦的引物更新方案。這些數據集旨在支援學術共同體內生物資訊學流程的基準測試、驗證和優化。

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📄 原文連結:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.15.725146v1?rss=1

🏷️ 安第斯病毒 病毒測序 擴增子測序 雜交捕獲 引物優化 生物資訊學基準

Administrator 2026年5月16日
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