藍牛肝菌屬、可可牛肝菌屬和銅色牛肝菌屬的全球界定(擔子菌門:牛肝菌科) 2026年5月17日 0 331 WEC技術前瞻 微生物學 本研究旨在彙編Cyanoboletus屬內部及其周邊的所有系統發育譜系。基於核糖體基因內部轉錄間隔區(ITS)的進化推斷表明,目前歸入Cyanoboletus的一部分物種實際上屬於獨立於該屬的譜系,因此提示應將該屬界定得更為狹窄,僅包括那些在受觸碰及菌肉暴露於空氣時會產生強烈變色反應的物種。 獨立的譜系包括單型屬Cupreoboletus,以及若干不發生此類反應的物種;後者與Cacaop... Read more
已滅絕鉅鹿(Megaloceros giganteus)的進化歷史與基因組脆弱性 2026年5月17日 0 417 WEC技術前瞻 進化生物學 已滅絕的鉅鹿(Megaloceros giganteus)是晚第四紀最引人注目的巨型動物群物種之一,其顯著特徵是擁有巨大的掌狀鹿角,展開寬度可達3.5米,為現生和已滅絕鹿科動物中已知最大者。儘管其具有標誌性地位,但關於其在約8千年前(kya)滅絕之前的基因組歷史,人們仍知之甚少。我們構建了首批鉅鹿核古基因組數據,包括來自德國(約40 kya)和愛爾蘭(約11 kya)的9個個體,並將其... Read more
步行過程中智能手機放置位置識別:性能決定因素與現實世界泛化能力 2026年5月17日 0 318 WEC技術前瞻 計算生物學 利用智能手機在較長時間內採集運動數據的機會,為臨床運動分析領域開闢了新的前景。然而,在自由生活條件下監測人們的移動能力時,智能手機的放置位置會影響所提取數字化移動性結局指標的有效性。本研究旨在開發並驗證一種智能手機放置位置自動識別分類器,並探究可能影響其性能的關鍵因素。 該分類器基於15名健康參與者的數據進行訓練,所用數據為智能手機在自由生活步行過程中放置於六種身體位置時採集的慣性信號... Read more
子代—種源試驗中十年病害調查數據:歐洲赤松中的紅斑針葉枯病 2026年5月17日 0 311 WEC技術前瞻 植物學 關於森林樹木疾病易感性的縱向數據較為罕見,但對於理解宿主—病原體動態以及易感性性狀中的遺傳變異至關重要。我們提供了一個長期、多地點的共同園試驗數據集,用於量化歐洲赤松(Pinus sylvestris)對紅斑針葉枯病的易感性。該數據集包括對同一批樹木連續11年開展的年度病害評估,涵蓋168個家系和蘇格蘭的21個種源。該設計能夠劃分遺傳與環境變異來源,評估宿主響應的時間穩定性,並估計易感性的... Read more
跨生態系統中隨深度變化的環境DNA丰度為深海採樣策略提供依據 2026年5月17日 0 353 WEC技術前瞻 生態學 環境DNA(eDNA)調查正日益用於評估海洋生物多樣性,併為深海環境決策提供依據,包括《BBNJ協定》框架下的決策、礦產資源管理以及漁業監管。然而,沿用自近岸研究的標準低體積採樣方案在深海環境中可能並不充分,而且目前尚無將水深與生態系統背景聯繫起來、以確定合理過濾體積目標的定量框架。我們彙編了來自北大西洋、大加勒比地區和太平洋八次海洋考察的841份eDNA樣品(表層至4000米),以量化可... Read more
基於頰黏膜DNA甲基化譜預測生物年齡和臨床生物標誌物 2026年5月17日 0 315 WEC技術前瞻 遺傳學 作者聲明如下財務利益/個人關係,這些關係可能被視為潛在的利益衝突: TS為Rhelixa Inc.的僱員。YT於2021年4月至2024年3月期間擔任該公司的統計科學技術顧問。RN為該公司的創始人兼首席執行官。 感謝您關注並傳播 bioRxiv。 注意:要求提供您的電子電郵地址僅用於將您識別為本文的發送者。 📄 原文連結: https://www.biorxiv.org/content/1... Read more
基於動物跟蹤數據的運動策略分割與輪廓分類 2026年5月17日 0 281 WEC技術前瞻 生態學 1. 基於GPS追蹤數據對動物運動策略進行分類,對於理解空間利用、種群動態及保護規劃至關重要。然而,現有方法要麼需要對軌跡形態作出較強的參數化假設,要麼在機器學習中依賴大規模有標籤數據集(即由專家標註的數據),要麼缺乏正式的不確定性量化。這些侷限為研究新物種或樣本量有限的研究者設置了障礙。 2. 我們提出了一種基於剖面的分類框架,由三個步驟組成。首先,利用應用於淨平方位移(Net Squa... Read more
MeaSeq評估:麻疹病毒全基因組序列的綜合分析與報告 2026年5月17日 0 312 WEC技術前瞻 生物資訊學 儘管麻疹病毒(MeV)可通過疫苗預防,但其仍持續構成重大的公共衛生挑戰,且全球病例出現了顯著反彈。隨着全基因組測序(WGS)成本日益降低並在公共衛生實驗室中被常規採用,對下一代測序(NGS)數據進行可靠且易於取得的分析對於暴發調查和分子監測至關重要。在此,我們提出了 MeaSeq,這是一種快速、用戶友好、開源的生物資訊學流程,可利用 Illumina 或 Oxford Nanopore... Read more
生物能量學起源中亞磷酸鹽參與的金屬催化磷酸化 2026年5月17日 0 282 WEC技術前瞻 生物化學 磷酸鹽如何成為生命普遍的能量貨幣?早期演化研究中關於磷酸化的傳統方法通常涉及烘箱乾燥、非水溶劑、具有危險反應性的磷形態,或其他非生理條件。以微生物生理學為指南,我們近期發現,亞磷酸鹽 HPO3^2− 可被許多微生物經酶促氧化,且天然存在於蛇紋岩化熱液噴口中;在純鹼性水溶液中、25–100°C 條件下,它能夠在數小時至數天內輕易使核糖、葡萄糖、甘油、絲氨酸、AMP、肌酸和乙酸發生磷酸化,生... Read more
墨西哥洞穴魚比較腦圖譜揭示了細胞組成和基因表達的自然發生變化 2026年5月17日 0 324 WEC技術前瞻 神經科學 理解自然發生的遺傳變異如何塑造人類健康與疾病,對於改進診斷和治療策略至關重要。墨西哥洞穴魚 Astyanax mexicanus 是進化醫學研究中的一個強有力模型系統,可用於探究針對多種疾病相關性狀——包括糖尿病、肥胖、失眠和眼退化——而自然進化形成的抗逆機制。A. mexicanus 的幼體與斑馬魚類似,具有透明性,因此能夠進行全腦成像、神經環路繪製,以及構建通過計算方法生成的圖譜,從... Read more
一種高通用性的即時定量RT-PCR方法及用於準確檢測柑橘黃脈褪綠病毒的取樣策略 2026年5月17日 0 286 WEC技術前瞻 植物學 柑橘黃脈明化病毒(Citrus yellow vein clearing virus, CYVCV)是一種新發病害的病原,其對柑橘生產構成了潛在的高影響威脅。儘管數十年來該病毒一直未進入歐洲,但如今CYVCV已擴展至兩個重要的歐洲柑橘生產國——意大利以及更近時期的西班牙。該病毒在EPPO區域內的存在構成了當前威脅,並可能對歐洲柑橘產業造成難以預測且潛在毀滅性的後果。因此,亟需採取緊急防護措... Read more
英國水禽獵獲量估算中不確定性來源的探討 2026年5月17日 0 326 生態學 歐洲迫切需要收集關於水鳥獵獲率的數據,以評估狩獵的可持續性。英國(UK)水鳥總獵獲量以及不同可獵物種相對獵獲量的估計,來自兩項獨立調查,即《射擊活動的價值》(Value of Shooting,PACEC 2014)和國家獵獲記錄普查(National Gamebag Census,NGC,Aebischer 2019);這些數據近期已被用於探討英國獵人對野生水鳥的獵獲是否可能不可持續(E... Read more