分子生物學
偽尿苷（Ψ）是許多非編碼RNA的重要轉錄後修飾，但由於歷史上偽尿苷定位方法的侷限性，miRNA中的該修飾一直缺乏充分表徵。Ψ修飾可穩定RNA雙鏈結構，因此可能在miRNA靶標結合與抑制中發揮重要作用。為探究哺乳動物miRNA被Ψ修飾的程度，我們採用亞硫酸氫鹽測序分析了人細胞和小鼠組織中短RNA（<30 nt）的修飾圖譜。我們的研究設計具備檢測小RNA偽尿苷化的能力，依據是對tRNA片段（tRFs）中已知Ψ位點的穩健檢測，其中部分位點表現出組織特異性的修飾模式。
與tRFs相比，我們發現miRNA的偽尿苷化極為罕見，僅在小鼠組織中鑑定到一個被修飾的miRNA（miR-3068-5p）。偽尿苷化的miR-3068-5p對預測的miRNA靶標表現出差異性抑制，且其作用對象具有更不穩定的miRNA:mRNA配對模式。本研究填補了轉錄組範圍Ψ譜分析中的長期空白，並揭示了Ψ作為小型調控RNA活性調節因子的一種新潛在功能。
作者聲明不存在競爭性利益。
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📄 原文連結：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.14.725264v1?rss=1
🏷️ 偽尿苷化 miRNA修飾 小RNA測序 亞硫酸氫鹽測序 tRNA片段