計算生物學
癌症進展日益被理解為一種進化過程,這一過程不僅受競爭驅動,也受合作性相互作用的塑造,其中包括通過可擴散“公共物品”(public goods, PGs)介導的合作。經典進化博弈論預測,在充分混合的非生產者群體中,PG 生產型(利他型)亞克隆無法成功入侵;然而,鑑於此類亞克隆已被觀察到會在腫瘤中出現,這一預測構成了一個悖論。在此,我們通過結合隨機空間模擬與解析上可處理的 Moran 模型,研究結構化群體中 PG 生產細胞的入侵動力學,從而解決這一矛盾。
從單個生產者細胞出發,我們在具有生物學相關性的參數範圍內,顯式建模了 PG 的隨機分泌、擴散、結合/解離以及細胞增殖過程。我們證明,空間結構從根本上改變了入侵動力學,使得 PG 生產者即使在生產帶來適應度代價的情況下,仍能夠入侵併建立。數值方法與解析方法均收斂於一個關鍵的統一參數——特徵長度尺度 δ,它刻畫了擴散率、結合動力學和降解作用的綜合效應。該長度尺度決定了 PG 可獲得性的空間範圍,從而決定了生產者的選擇優勢。
我們識別出不同的機制區間:當 PG 局域化時(δ 較小),生產者會優先受益,因而更可能發生入侵;當 PG 廣泛分散時(δ 較大),收益被共享,入侵趨於中性,或因代價而受到抑制。我們的結果強調,合作性性狀的入侵受空間介導的資源局域化支配,而非僅由內在適應度決定。該框架為理解腫瘤中合作性亞克隆的出現提供了機制基礎,並提示調控信號分子生物物理傳輸性質可能影響腫瘤進化、轉移和治療耐藥性。
📄 原文連結:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.14.725277v1?rss=1
🏷️ 癌症進化 公共物品 空間結構 入侵動力學 Moran模型 進化博弈