免疫学
新抗原是由基因组改变产生的癌症特异性抗原。单氨基酸变异（Single Amino Acid Variants, SAAVs）构成了这类新抗原的主要类别。为了评估来源于神经纤维蛋白1（Neurofibromin 1, NF1）的SAAVs的治疗潜力——鉴于NF1在恶性脑肿瘤中经常发生突变——我们结合计算预测与实验验证，优先筛选出40个被判定为可与HLA-A*02:01结合的NF1 SAAVs。
为验证这些预测的新表位，我们在HLA-A*02:01纯合的U87-MG细胞中采用了双层实验策略。首先，我们合成了编码预测新表位的小基因构建体，通过慢病毒转染将其导入细胞，并通过质谱（MS）确认其表达。随后，我们采用泛HLA免疫沉淀质谱（IP-MS）进行内源性验证，证实了40个候选SAAVs中的4个（共10个新表位）。
我们观察到计算机预测结果与实际观测到的序列之间存在差异。我们的内源性肽组学分析进一步揭示了保守的肽基序，并表明用于HLA呈递的肽筛选具有瞬时性。尽管我们的研究证实了靶向NF1突变的T细胞免疫疗法在治疗上的可行性，但这些结果也凸显了当前计算预测方法的局限性。我们的研究强调了实验验证对于优化新抗原优先级筛选策略的必要性。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.10.724138v1?rss=1
🏷️ 新抗原 NF1突变 HLA-I呈递 肽组学质谱 肿瘤免疫治疗