水力压裂诱导的分层与外渗使主动脉夹层中中膜损伤扩展至假腔之外 2026年5月16日 0 176 医学 主动脉夹层因中膜完整性持续丧失而危及生命,这一过程可在数小时至数天内最终导致继发性破裂。尽管既存缺陷或血流动力学负荷会加剧主动脉结构恶化,但从有症状的夹层通道进展为致命性全层撕裂的病理过程仍知之甚少。我们采用显微镜检查了参照组及急性夹层升主动脉的结构。未发生夹层的中膜中,弹性成分、胶原成分和细胞成分彼此精细交联。夹层病变中的中膜损伤可从入口部追踪至中央区域再至周边区域。入口撕裂整齐地贯穿连续... 中膜损伤 主动脉夹层 假腔形成 水力压裂 血液外渗 Read more
产生公共产品的亚克隆能否侵入由非生产者组成的种群? 2026年5月16日 0 150 计算生物学 癌症进展日益被理解为一种进化过程,这一过程不仅受竞争驱动,也受合作性相互作用的塑造,其中包括通过可扩散“公共物品”(public goods, PGs)介导的合作。经典进化博弈论预测,在充分混合的非生产者群体中,PG 生产型(利他型)亚克隆无法成功入侵;然而,鉴于此类亚克隆已被观察到会在肿瘤中出现,这一预测构成了一个悖论。在此,我们通过结合随机空间模拟与解析上可处理的 Moran 模型... Moran模型 入侵动力学 公共物品 癌症进化 空间结构 进化博弈 Read more
安第斯病毒测序准备的方法学评估与数据资源 2026年5月16日 0 108 生物信息学 摘要 作为支持英国高后果传染病(HCID)框架下分类病原体相关准备工作的一部分,我们此前评估了两种用于安第斯病毒(ANDV)测序的方法:一种是全基因组平铺式扩增子测序方案,另一种是泛病毒杂交捕获方法(TWIST-CVRP)。 鉴于近期暴发事件,我们现公开使用历史性ANDV分离株(智利,1997年)生成的病毒测序数据集。此外,我们还提供了对平铺式扩增子方案性能的评估,并基于与近期发布的暴... 安第斯病毒 引物优化 扩增子测序 杂交捕获 生物信息学基准 病毒测序 Read more
红藻条斑紫菜和线形紫菜的染色体水平基因组组装 2026年5月16日 0 141 生物信息学 作为最早分化的多细胞真核生物谱系之一,叶状红毛菜目(Bangiales,红藻门)具有深远的进化历史,并在价值数十亿美元的全球海藻水产养殖产业中发挥核心作用。尽管北大西洋代表种正逐渐成为区域海水养殖的潜在候选对象,但这些类群高质量基因组资源的匮乏阻碍了基础研究和商业优化。为此,我们报告了两个欧洲本土物种的首个染色体水平基因组组装:Porphyra dioica(150.44 Mbp)和 ... Hi-C 基因组组装 染色体水平 水产养殖 红藻 Read more
加勒比海珊瑚的繁殖权衡:可塑性加速繁殖能力形成,而碎片化延缓繁殖能力形成 2026年5月16日 0 143 生态学 在模块化生物中,生长与断裂使个体边界变得模糊,无性生殖与有性生殖之间的相互作用会产生复杂的适应度权衡。生活史理论预测,分配给某一适应度组分的资源必然会减少对其他组分的投入,然而,在克隆生物的野外种群中检测这些权衡仍然具有挑战性。表型可塑性能够提高生存率,但其对繁殖能力和生活史权衡的影响仍知之甚少。通过采用完全交叉的互易移植设计,我们在42个月内追踪了分布于9个礁点的263个鹿角珊瑚(Acr... 互易移植 无性生殖 有性生殖 珊瑚繁殖 生活史权衡 表型可塑性 Read more
全基因组序列的计算机模拟限制性位点分析揭示了由选择作用和序列重复引起的模式 2026年5月16日 0 131 生物信息学 众所周知,生物序列并非随机。因此,对随机序列与生物序列的计算机模拟限制性片段分布进行比较,可以作为这种非随机性的一个指标。我们的分析表明,对于大多数已测试的限制性内切酶与基因组序列组合,生物序列中每兆碱基的片段数相较于相应随机序列至少偏离10%以上。这种偏离呈现双向性,即明显升高的数值与明显降低的数值同样常见。尽管不存在物种特异性或限制性内切酶特异性的效应,但可以清楚地观察到限制性位点... GC含量 全基因组序列 序列重复 计算机模拟 限制性位点分析 Read more
基于刀豆氨酸检测染色体大规模重排的方法揭示了裂殖酵母中的基因组不稳定性热点及其调控基因 2026年5月16日 0 119 遗传学 大规模染色体重排是许多疾病和癌症的标志性特征。其生物发生及其形成机制的研究,因模式生物中遗传报告检测体系的可获得性而得到极大促进。本文介绍了一种在裂殖酵母中开发的新型GCR检测体系;裂殖酵母是理解与人类生物学相关的基因组不稳定性的高度相关模型。该报告系统采用刀豆氨酸反向筛选,在染色体背景下检测GCR。利用该检测体系,我们鉴定出GCR的天然热点,其中包括反向长末端重复序列(IR-LTRs)。... 反向长末端重复 基因组不稳定性 断裂诱导复制 染色体大规模重排 核孔复合体 裂殖酵母 Read more
泛基因组参考组装揭示了人类LINE-1逆转座子的变异及其近期活性 2026年5月16日 0 145 遗传学 LINE-1逆转座子是人类基因组中目前仍然活跃的唯一自主移动元件,并且仍然是突变、基因组重塑和疾病风险的重要来源。然而,年轻的、全长的、潜在活性的拷贝(即最有可能塑造当代基因组的元件)由于长度较长、重复性高且难以通过短读长测序清晰解析,长期以来基本无法进行群体尺度分析。在本研究中,我们利用人类泛基因组参考联盟的47个定相长读长组装结果(代表94条单倍型),构建了近期人类LINE-1演化的等... LINE-1逆转座子 泛基因组 结构变异 群体遗传多样性 转座子活性 长读长组装 Read more
基于Ilastik的易用且低成本的叶片病害定量分析工作流程 2026年5月16日 0 113 植物学 对叶部病害严重度进行准确且可重复的评估,对于评价异质性植物群落的表现以及理解寄主—病原体相互作用至关重要。然而,传统的目测评分方法仍然具有主观性、精度有限,并且难以在大规模表型分析实验中推广。在此,我们提出了一种半自动化图像分析工作流程,旨在同时定量分析从品种混合种植中采集的小麦旗叶上的多种叶部病害症状。 该工作流程结合了三个方法学组成部分:(i)标准化的叶片采样与成像协议;(ii)采用在... 图像分析 小麦 机器学习分割 植物病害 表型分析 Read more
ATF4 在 β-连环蛋白驱动的肝细胞癌中调控脯氨酸依赖性的免疫逃逸 2026年5月16日 0 149 医学 摘要 背景与目的 肝细胞癌(HCC)常对免疫检查点抑制剂(ICIs)产生耐药,尤其是在以β-连环蛋白驱动并以免疫排斥为特征的肿瘤中更为显著。尽管未折叠蛋白反应(UPR)和整合性应激反应(ISR)能够使肿瘤适应代谢应激,但其在塑造肿瘤免疫原性中的作用仍未得到充分阐明。我们研究了ATF4这一整合性应激反应的核心效应因子是否将代谢重编程与HCC中抗肿瘤免疫的抑制相耦联。 方法 我们结合了三个独立人... ATF4 β-连环蛋白 代谢重编程 免疫逃逸 肝细胞癌 肿瘤微环境 Read more
衰老细胞诱导血管MHC II募集CD4+ T细胞并推动老龄脂肪组织中的炎症 2026年5月16日 0 169 免疫学 脂肪组织在衰老过程中表现出显著的炎症,然而维持这种慢性状态的机制尚不清楚。通过构建一个整合组织学、单核转录组学和流式细胞术并覆盖小鼠整个生命周期的图谱,我们发现,与中年期观察到的类肥胖炎症谱不同,年龄相关性炎症具有独特特征。具体而言,年龄相关性炎症的特征在于强烈的干扰素-γ(IFNγ)反应特征以及T细胞的积累。我们证明,衰老细胞作为上游触发因素,间接启动IFNγ反应,上调血管主要组织相容性... CD4+ T细胞 IFNγ MHC II 免疫浸润 脂肪组织炎症 衰老细胞 Read more
分布式克隆删除可防止自身免疫性疾病进展 2026年5月16日 0 113 免疫学 自反应性B细胞在正常发育过程中会产生,并可在活化后通过活化诱导的胞苷脱氨酶(AID)介导的多样化获得更强的致病性。克隆删除被认为能够清除这些细胞,然而,为防止自身免疫性疾病,克隆删除如何分布于发育与活化的不同阶段仍不清楚。在此,我们表明,克隆删除是通过时间上相互区分的线粒体凋亡(MOMP)检查点来执行的,这些检查点以差异化方式调控自反应性B细胞的命运和疾病进展。 通过使用条件性Bcl-2表... AID B细胞 IgG自身抗体 克隆删除 线粒体凋亡 自身免疫 Read more