Blog Posts | 全胚胎旋转培养系统_WEC001-GT_Adawarbler

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基因组公平可及性框架（GEAF）：用于建模基因组疗法与再生疗法可负担性和公平性的量纲一致框架

**背景：** 基于CRISPR的基因编辑技术和干细胞来源的胚胎模型不断取得进展，在带来重大生物医学机遇的同时，也引发了显著的伦理与分配问题。截至本文撰写时，在美国获批的个体化基因组学和再生医学疗法，其标价约为220万美元（Casgevy）至425万美元（Lenmeldy），另有数种获批产品的价格介于两者之间（例如，Lyfgenia为310万美元；Hemgenix为350万美元）。由此引发的问题是...

蓝牛肝菌属、可可牛肝菌属和铜色牛肝菌属的全球界定（担子菌门：牛肝菌科）

2026年5月17日

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微生物学本研究旨在汇编Cyanoboletus属内部及其周边的所有系统发育谱系。基于核糖体基因内部转录间隔区（ITS）的进化推断表明，目前归入Cyanoboletus的一部分物种实际上属于独立于该属的谱系，因此提示应将该属界定得更为狭窄，仅包括那些在受触碰及菌肉暴露于空气时会产生强烈变色反应的物种。独立的谱系包括单型属Cupreoboletus，以及若干不发生此类反应的物种；后者与Cacaop...

已灭绝巨鹿（Megaloceros giganteus）的进化历史与基因组脆弱性

2026年5月17日

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进化生物学已灭绝的巨鹿（Megaloceros giganteus）是晚第四纪最引人注目的巨型动物群物种之一，其显著特征是拥有巨大的掌状鹿角，展开宽度可达3.5米，为现生和已灭绝鹿科动物中已知最大者。尽管其具有标志性地位，但关于其在约8千年前（kya）灭绝之前的基因组历史，人们仍知之甚少。我们构建了首批巨鹿核古基因组数据，包括来自德国（约40 kya）和爱尔兰（约11 kya）的9个个体，并将其...

步行过程中智能手机放置位置识别：性能决定因素与现实世界泛化能力

2026年5月17日

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计算生物学利用智能手机在较长时间内采集运动数据的机会，为临床运动分析领域开辟了新的前景。然而，在自由生活条件下监测人们的移动能力时，智能手机的放置位置会影响所提取数字化移动性结局指标的有效性。本研究旨在开发并验证一种智能手机放置位置自动识别分类器，并探究可能影响其性能的关键因素。该分类器基于15名健康参与者的数据进行训练，所用数据为智能手机在自由生活步行过程中放置于六种身体位置时采集的惯性信号...

子代—种源试验中十年病害调查数据：欧洲赤松中的红斑针叶枯病

2026年5月17日

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植物学关于森林树木疾病易感性的纵向数据较为罕见，但对于理解宿主—病原体动态以及易感性性状中的遗传变异至关重要。我们提供了一个长期、多地点的共同园试验数据集，用于量化欧洲赤松（Pinus sylvestris）对红斑针叶枯病的易感性。该数据集包括对同一批树木连续11年开展的年度病害评估，涵盖168个家系和苏格兰的21个种源。该设计能够划分遗传与环境变异来源，评估宿主响应的时间稳定性，并估计易感性的...

跨生态系统中随深度变化的环境DNA丰度为深海采样策略提供依据

2026年5月17日

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生态学环境DNA（eDNA）调查正日益用于评估海洋生物多样性，并为深海环境决策提供依据，包括《BBNJ协定》框架下的决策、矿产资源管理以及渔业监管。然而，沿用自近岸研究的标准低体积采样方案在深海环境中可能并不充分，而且目前尚无将水深与生态系统背景联系起来、以确定合理过滤体积目标的定量框架。我们汇编了来自北大西洋、大加勒比地区和太平洋八次海洋考察的841份eDNA样品（表层至4000米），以量化可...

基于颊黏膜DNA甲基化谱预测生物年龄和临床生物标志物

2026年5月17日

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遗传学作者声明如下财务利益/个人关系，这些关系可能被视为潜在的利益冲突： TS为Rhelixa Inc.的雇员。YT于2021年4月至2024年3月期间担任该公司的统计科学技术顾问。RN为该公司的创始人兼首席执行官。感谢您关注并传播 bioRxiv。注意：要求提供您的电子邮箱地址仅用于将您识别为本文的发送者。 📄 原文链接： https://www.biorxiv.org/content/1...

基于动物跟踪数据的运动策略分割与轮廓分类

2026年5月17日

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生态学 1. 基于GPS追踪数据对动物运动策略进行分类，对于理解空间利用、种群动态及保护规划至关重要。然而，现有方法要么需要对轨迹形态作出较强的参数化假设，要么在机器学习中依赖大规模有标签数据集（即由专家标注的数据），要么缺乏正式的不确定性量化。这些局限为研究新物种或样本量有限的研究者设置了障碍。 2. 我们提出了一种基于剖面的分类框架，由三个步骤组成。首先，利用应用于净平方位移（Net Squa...

MeaSeq评估：麻疹病毒全基因组序列的综合分析与报告

2026年5月17日

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生物信息学尽管麻疹病毒（MeV）可通过疫苗预防，但其仍持续构成重大的公共卫生挑战，且全球病例出现了显著反弹。随着全基因组测序（WGS）成本日益降低并在公共卫生实验室中被常规采用，对下一代测序（NGS）数据进行可靠且易于获取的分析对于暴发调查和分子监测至关重要。在此，我们提出了 MeaSeq，这是一种快速、用户友好、开源的生物信息学流程，可利用 Illumina 或 Oxford Nanopore...

生物能量学起源中亚磷酸盐参与的金属催化磷酸化

2026年5月17日

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生物化学磷酸盐如何成为生命普遍的能量货币？早期演化研究中关于磷酸化的传统方法通常涉及烘箱干燥、非水溶剂、具有危险反应性的磷形态，或其他非生理条件。以微生物生理学为指南，我们近期发现，亚磷酸盐 HPO3^2− 可被许多微生物经酶促氧化，且天然存在于蛇纹岩化热液喷口中；在纯碱性水溶液中、25–100°C 条件下，它能够在数小时至数天内轻易使核糖、葡萄糖、甘油、丝氨酸、AMP、肌酸和乙酸发生磷酸化，生...

墨西哥洞穴鱼比较脑图谱揭示了细胞组成和基因表达的自然发生变化

2026年5月17日

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神经科学理解自然发生的遗传变异如何塑造人类健康与疾病，对于改进诊断和治疗策略至关重要。墨西哥洞穴鱼 Astyanax mexicanus 是进化医学研究中的一个强有力模型系统，可用于探究针对多种疾病相关性状——包括糖尿病、肥胖、失眠和眼退化——而自然进化形成的抗逆机制。A. mexicanus 的幼体与斑马鱼类似，具有透明性，因此能够进行全脑成像、神经环路绘制，以及构建通过计算方法生成的图谱，从...

一种高通用性的实时定量RT-PCR方法及用于准确检测柑橘黄脉褪绿病毒的取样策略

2026年5月17日

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植物学柑橘黄脉明化病毒（Citrus yellow vein clearing virus, CYVCV）是一种新发病害的病原，其对柑橘生产构成了潜在的高影响威胁。尽管数十年来该病毒一直未进入欧洲，但如今CYVCV已扩展至两个重要的欧洲柑橘生产国——意大利以及更近时期的西班牙。该病毒在EPPO区域内的存在构成了当前威胁，并可能对欧洲柑橘产业造成难以预测且潜在毁灭性的后果。因此，亟需采取紧急防护措...

英国水禽猎获量估算中不确定性来源的探讨

2026年5月17日

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生态学欧洲迫切需要收集关于水鸟猎获率的数据，以评估狩猎的可持续性。英国（UK）水鸟总猎获量以及不同可猎物种相对猎获量的估计，来自两项独立调查，即《射击活动的价值》（Value of Shooting，PACEC 2014）和国家猎获记录普查（National Gamebag Census，NGC，Aebischer 2019）；这些数据近期已被用于探讨英国猎人对野生水鸟的猎获是否可能不可持续（E...

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