WEC 技術展望 | 胚・オルガノイド培養研究

WEC 技術展望

无性适应驱动交配效率的短暂且可逆变化。

2026/05/16

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进化生物学生殖隔离的演化是物种形成的核心，但这一过程的最早期阶段仍然知之甚少。尤其是，在适应过程中，交配屏障形成的速度有多快、它们是否以可预测的方式累积，以及它们如何依赖于生态背景，这些问题仍不明确。在此，我们研究了二倍体酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）在长期无性适应过程中交配效率的演化。12个重复种群在两种不同的碳源环境——葡萄糖和半乳糖——中，在严格无性条件下演化...

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用于其信号网络分层分析的绿色基因编码IP3生物传感器

2026/05/16

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生物化学肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）是一种关键的第二信使，调控多种生理过程。因此，在活细胞中可视化IP3动态对于理解其信号传导过程具有重要意义。在本研究中，我们开发了遗传编码的绿色荧光IP3生物传感器，命名为 Green iPenguins，其对IP3具有不同的半数最大效应浓度（EC50），从而能够在一定浓度范围内检测IP3信号。这些生物传感器在结合IP3后荧光强度增加超过4倍，并且相较于结...

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水力压裂诱导的分层与外渗使主动脉夹层中中膜损伤扩展至假腔之外

2026/05/16

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医学主动脉夹层因中膜完整性持续丧失而危及生命，这一过程可在数小时至数天内最终导致继发性破裂。尽管既存缺陷或血流动力学负荷会加剧主动脉结构恶化，但从有症状的夹层通道进展为致命性全层撕裂的病理过程仍知之甚少。我们采用显微镜检查了参照组及急性夹层升主动脉的结构。未发生夹层的中膜中，弹性成分、胶原成分和细胞成分彼此精细交联。夹层病变中的中膜损伤可从入口部追踪至中央区域再至周边区域。入口撕裂整齐地贯穿连续...

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产生公共产品的亚克隆能否侵入由非生产者组成的种群？

2026/05/16

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计算生物学癌症进展日益被理解为一种进化过程，这一过程不仅受竞争驱动，也受合作性相互作用的塑造，其中包括通过可扩散“公共物品”（public goods, PGs）介导的合作。经典进化博弈论预测，在充分混合的非生产者群体中，PG 生产型（利他型）亚克隆无法成功入侵；然而，鉴于此类亚克隆已被观察到会在肿瘤中出现，这一预测构成了一个悖论。在此，我们通过结合随机空间模拟与解析上可处理的 Moran 模型...

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安第斯病毒测序准备的方法学评估与数据资源

2026/05/16

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生物信息学摘要作为支持英国高后果传染病（HCID）框架下分类病原体相关准备工作的一部分，我们此前评估了两种用于安第斯病毒（ANDV）测序的方法：一种是全基因组平铺式扩增子测序方案，另一种是泛病毒杂交捕获方法（TWIST-CVRP）。鉴于近期暴发事件，我们现公开使用历史性ANDV分离株（智利，1997年）生成的病毒测序数据集。此外，我们还提供了对平铺式扩增子方案性能的评估，并基于与近期发布的暴...

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红藻条斑紫菜和线形紫菜的染色体水平基因组组装

2026/05/16

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生物信息学作为最早分化的多细胞真核生物谱系之一，叶状红毛菜目（Bangiales，红藻门）具有深远的进化历史，并在价值数十亿美元的全球海藻水产养殖产业中发挥核心作用。尽管北大西洋代表种正逐渐成为区域海水养殖的潜在候选对象，但这些类群高质量基因组资源的匮乏阻碍了基础研究和商业优化。为此，我们报告了两个欧洲本土物种的首个染色体水平基因组组装：Porphyra dioica（150.44 Mbp）和 ...

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加勒比海珊瑚的繁殖权衡：可塑性加速繁殖能力形成，而碎片化延缓繁殖能力形成

2026/05/16

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生态学在模块化生物中，生长与断裂使个体边界变得模糊，无性生殖与有性生殖之间的相互作用会产生复杂的适应度权衡。生活史理论预测，分配给某一适应度组分的资源必然会减少对其他组分的投入，然而，在克隆生物的野外种群中检测这些权衡仍然具有挑战性。表型可塑性能够提高生存率，但其对繁殖能力和生活史权衡的影响仍知之甚少。通过采用完全交叉的互易移植设计，我们在42个月内追踪了分布于9个礁点的263个鹿角珊瑚（Acr...

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全基因组序列的计算机模拟限制性位点分析揭示了由选择作用和序列重复引起的模式

2026/05/16

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生物信息学众所周知，生物序列并非随机。因此，对随机序列与生物序列的计算机模拟限制性片段分布进行比较，可以作为这种非随机性的一个指标。我们的分析表明，对于大多数已测试的限制性内切酶与基因组序列组合，生物序列中每兆碱基的片段数相较于相应随机序列至少偏离10%以上。这种偏离呈现双向性，即明显升高的数值与明显降低的数值同样常见。尽管不存在物种特异性或限制性内切酶特异性的效应，但可以清楚地观察到限制性位点...

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基于刀豆氨酸检测染色体大规模重排的方法揭示了裂殖酵母中的基因组不稳定性热点及其调控基因

2026/05/16

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遗传学大规模染色体重排是许多疾病和癌症的标志性特征。其生物发生及其形成机制的研究，因模式生物中遗传报告检测体系的可获得性而得到极大促进。本文介绍了一种在裂殖酵母中开发的新型GCR检测体系；裂殖酵母是理解与人类生物学相关的基因组不稳定性的高度相关模型。该报告系统采用刀豆氨酸反向筛选，在染色体背景下检测GCR。利用该检测体系，我们鉴定出GCR的天然热点，其中包括反向长末端重复序列（IR-LTRs）。...

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泛基因组参考组装揭示了人类LINE-1逆转座子的变异及其近期活性

2026/05/16

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遗传学 LINE-1逆转座子是人类基因组中目前仍然活跃的唯一自主移动元件，并且仍然是突变、基因组重塑和疾病风险的重要来源。然而，年轻的、全长的、潜在活性的拷贝（即最有可能塑造当代基因组的元件）由于长度较长、重复性高且难以通过短读长测序清晰解析，长期以来基本无法进行群体尺度分析。在本研究中，我们利用人类泛基因组参考联盟的47个定相长读长组装结果（代表94条单倍型），构建了近期人类LINE-1演化的等...

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基于Ilastik的易用且低成本的叶片病害定量分析工作流程

2026/05/16

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植物学对叶部病害严重度进行准确且可重复的评估，对于评价异质性植物群落的表现以及理解寄主—病原体相互作用至关重要。然而，传统的目测评分方法仍然具有主观性、精度有限，并且难以在大规模表型分析实验中推广。在此，我们提出了一种半自动化图像分析工作流程，旨在同时定量分析从品种混合种植中采集的小麦旗叶上的多种叶部病害症状。该工作流程结合了三个方法学组成部分：（i）标准化的叶片采样与成像协议；（ii）采用在...

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ATF4 在 β-连环蛋白驱动的肝细胞癌中调控脯氨酸依赖性的免疫逃逸

2026/05/16

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WEC 技術展望

医学摘要背景与目的肝细胞癌（HCC）常对免疫检查点抑制剂（ICIs）产生耐药，尤其是在以β-连环蛋白驱动并以免疫排斥为特征的肿瘤中更为显著。尽管未折叠蛋白反应（UPR）和整合性应激反应（ISR）能够使肿瘤适应代谢应激，但其在塑造肿瘤免疫原性中的作用仍未得到充分阐明。我们研究了ATF4这一整合性应激反应的核心效应因子是否将代谢重编程与HCC中抗肿瘤免疫的抑制相耦联。方法我们结合了三个独立人...

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