微生物學
麻疹病毒仍然是一個重大的全球健康威脅，儘管已有有效疫苗可用，但近年來全球麻疹病例仍持續增加。基因組監測已成為監測病毒傳播和調查暴發情況的重要工具。在此，我們描述了一種採用平鋪擴增子策略和 Illumina 測序技術進行麻疹病毒全基因組測序的濕實驗方法。此前發表的一種基於 Oxford Nanopore 的平鋪引物方案經過調整，以納入當前傳播的麻疹基因型，並適用於 Illumina 平台。
研究對兩種 Illumina 文庫製備試劑盒——Illumina DNA Prep（IDP）和 Nextera XT（XT）——的性能進行了評估。與 XT 相比，IDP 試劑盒表現出更完整的基因組和更一致的基因組覆蓋度。利用定量參考基因組，確定 B3 和 D8 基因型的檢測限為 10,000 個基因組拷貝。序列準確性通過先前已表徵的臨床樣本進行了評估，結果顯示出高度一致性。該方法為在 Illumina 平台上進行麻疹病毒全基因組測序提供了一種可靠且靈敏的途徑，適用於基因組監測應用。
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📄 原文連結：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.724913v1?rss=1
🏷️ 麻疹病毒 全基因組測序 Illumina測序 平鋪擴增子 基因組監測