計算生物學
LD Score Regression（LDSC）是一種重要的方法，它通過對與目標性狀相對應的GWAS檢驗統計量與LD評分進行線性迴歸，並利用其斜率從彙總統計量中估計全基因組SNP遺傳力。LDSC的作者曾聲稱，迴歸中的自由截距能夠校正諸如群體分層等混雜偏倚。在本研究中，我們認為，為了準確估計SNP遺傳力，LDSC中的截距必須固定為1。我們通過理論分析和模擬研究表明，所估計的截距並不能準確捕捉群體分層效應；相反，它會通過引入偏倚並增大方差而損害遺傳力估計的準確性。
當不存在群體分層時，將截距固定為1可以消除偏倚並降低方差。另一方面，在存在群體分層的情況下，無論截距是自由估計還是固定，LDSC都會產生偏倚。此外，我們還表明，LDSC中的標準誤估計被低估，這可能導致後續GWAS分析中出現假陽性。
作者聲明不存在競爭性利益。
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📄 原文連結：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.724972v1?rss=1
🏷️ GWAS LDSC SNP遺傳力 彙總統計量 群體分層 方法偏倚