生物資訊學
城市農業日益依賴基於堆肥的基質以實現可持續生產，然而，對於這類系統如何響應旨在引入有益微生物群的生物修飾劑，我們仍缺乏清晰的表徵。在本研究中，我們考察了發育階段以及叢枝菌根真菌（AMF）與解磷細菌（PSB）共接種如何重塑生長於城市農場堆肥基質中的番茄（Solanum lycopersicum）根際微生物功能。
通過植物生理測定、16S rRNA擴增子測序以及基於宏基因組資訊的宏蛋白質組學，我們表徵了在開花期和結果期、對照組、單獨接種AMF組、單獨接種PSB組以及AMF與PSB共接種組條件下，番茄的生理響應和根際微生物活性。共接種協同富集了有益類群，改善了果實養分積累，提高了營養轉運蛋白和群體感應蛋白的產量，並在競爭中被排斥的類群中驅動了由脅迫誘導的休眠，且這些響應在不同發育階段之間存在差異。
我們的研究結果確立了基於宏基因組資訊的宏蛋白質組學對於解析番茄發育過程以及AMF與PSB共接種所引發的根際微生物組階段特異性功能響應的重要性。
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📄 原文連結：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.12.724390v1?rss=1
🏷️ 宏蛋白質組學 根際微生物組 AMF-PSB共接種 番茄 發育階段 堆肥基質