免疫學
新抗原是由基因組改變產生的癌症特異性抗原。單氨基酸變異（Single Amino Acid Variants, SAAVs）構成了這類新抗原的主要類別。為了評估來源於神經纖維蛋白1（Neurofibromin 1, NF1）的SAAVs的治療潛力——鑑於NF1在惡性腦腫瘤中經常發生突變——我們結合計算預測與實驗驗證，優先篩選出40個被判定為可與HLA-A*02:01結合的NF1 SAAVs。
為驗證這些預測的新表位，我們在HLA-A*02:01純合的U87-MG細胞中採用了雙層實驗策略。首先，我們合成了編碼預測新表位的小基因構建體，通過慢病毒轉染將其導入細胞，並通過質譜（MS）確認其表達。隨後，我們採用泛HLA免疫沉澱質譜（IP-MS）進行內源性驗證，證實了40個候選SAAVs中的4個（共10個新表位）。
我們觀察到計算機預測結果與實際觀測到的序列之間存在差異。我們的內源性肽組學分析進一步揭示了保守的肽基序，並表明用於HLA呈遞的肽篩選具有瞬時性。儘管我們的研究證實了靶向NF1突變的T細胞免疫療法在治療上的可行性，但這些結果也凸顯了當前計算預測方法的侷限性。我們的研究強調了實驗驗證對於優化新抗原優先級篩選策略的必要性。
📄 原文連結：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.10.724138v1?rss=1
🏷️ 新抗原 NF1突變 HLA-I呈遞 肽組學質譜 腫瘤免疫治療