莽草酸途徑為植物初生代謝和次生代謝中的酚類代謝物提供前體。利用一種新型同位素異構體 MS/MS 方法，對完整擬南芥葉片中的碳通量進行測定，揭示了分枝酸與異分枝酸庫之間出人意料的動態關係。13CO2 標記動力學表明，來源於葉綠體的莽草酸是一個主要的分流點，其中約三分之一從葉綠體轉運出去。相比之下，分枝酸的小型代謝庫主要定位於葉綠體內，並且週轉迅速，在數分鐘內標記率即超過 70%。
異分枝酸作為十字花目植物中水楊酸（SA）的前體，其摩爾含量比分枝酸高 50 倍，但標記速度較慢，並且似乎主要位於葉綠體外。在缺失異分枝酸輸出蛋白的擬南芥高感病性突變體中，異分枝酸總量下降了 90%。非水分級進一步支援分枝酸代謝庫主要定位於葉綠體，而異分枝酸則位於質體外。毛果楊（Populus trichocarpa）和本氏煙草（Nicotiana benthamiana）葉片中含有分枝酸，但僅含有痕量異分枝酸，這與其採用苯甲酰輔酶 A 途徑合成 SA 相一致。
碳分配計算表明，在擬南芥葉片中，總分枝酸庫約有三分之一被分流至異分枝酸。基於元素分析-同位素比質譜法和靶向同位素回收的整葉計算表明，在光合葉肉組織中，僅有總同化碳的 0.03%（5.27 pmol∙mg-1 D.W.∙min-1）進入莽草酸途徑。相比之下，約 0.05%（7.75 pmol∙mg-1 D.W.∙min-1）進入 2-C-甲基-D-赤蘚糖醇 4-磷酸（MEP）途徑，該途徑為光合色素和電子載體提供前體。
莽草酸、分枝酸和異分枝酸的區室化及其週轉動態表明，葉肉組織對芳香族前體的持續需求與對 MEP 途徑來源色素的需求相當。
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