生物資訊學
宿主遺傳塑造腸道微生物組組成，然而這一關係背後的生理機制仍知之甚少。表徵宿主基因表達與黏膜微生物組之間的關聯，為識別最有可能發生生理性相互作用的宿主通路和微生物類群提供了一條有前景的路徑。然而，現有研究主要在急性疾病背景下以及結腸內開展，使得急性炎症背景之外的宿主—微生物組關聯，以及發生在末端迴腸等取樣不足區域中的此類關聯，尚未得到充分表徵。
為填補這些空白，我們對克羅恩病患者手術過程中取得的、來自三個腸道部位的肉眼無炎症組織進行了配對分析，包括全層切除標本的宿主基因表達譜和黏膜微生物組數據：末端迴腸（n = 32）、盲腸（n = 35）和右側結腸（n = 30）。採用包括 Procrustes 分析、稀疏典型相關分析和彈性網絡迴歸在內的多層次分析框架，我們鑑定出黏膜轉錄組與微生物組之間的顯著關聯。在整個腸道範圍內，富集於免疫和腸屏障完整性通路的基因與具有可遺傳性的類群相關，包括
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📄 原文連結：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.13.725025v1?rss=1
🏷️ 腸道微生物組 宿主轉錄組 宿主-微生物互作 區域特異性 克羅恩病 黏膜免疫