背景:多重耐药(MDR)细菌在全球范围内的增多构成了严重的公共卫生威胁,而罗马尼亚位列欧洲受影响最严重的国家之一。随着传统治疗手段日益失效,噬菌体治疗重新成为一种有前景的抗生素替代方案。受耐药菌株污染的城市河流,作为分离具有治疗潜力的裂解性噬菌体的一个尚未得到充分探索且易于获取的来源,具有重要价值。
方法:以MDR大肠杆菌为宿主菌,从罗马尼亚布加勒斯特的登博维察河中分离获得了两株噬菌体,分别命名为17M_Ec17_D和22C_Ec22_D。噬菌体表征包括噬菌斑形态观察、透射电子显微镜分析,以及采用点滴法对30株MDR大肠杆菌分离株进行宿主范围评估。全基因组测序采用Illumina MiSeq和Oxford Nanopore Technologies MinION平台完成,随后进行了包括分类学鉴定、生活方式预测和功能注释在内的生物信息学分析。
结果:两株噬菌体均形成清晰噬菌斑,并分别被归类为Kayfunavirus(17M_Ec17_D,类Podoviridae)和Kagunavirus(22C_Ec22_D,类Siphoviridae);其与各自最接近亲缘噬菌体的核苷酸相似性分别为89.2%和71.4%,表明二者均可能为新物种候选者。宿主范围分析显示,它们分别对13%和10%的受测MDR分离株具有裂解活性,且感染谱具有互补性。
基因组分析证实两株噬菌体均为严格裂解型,其依据包括存在holin和spanin基因,以及不存在溶原性模块、抗生素耐药基因和毒力因子。
结论:据我们所知,这是罗马尼亚首次开展针对MDR大肠杆菌的裂解性噬菌体分离及基因组学表征研究。所表征的噬菌体是安全的治疗候选者,其互补性的宿主范围提示其有望作为噬菌体鸡尾酒制剂的一部分,以扩大对MDR感染的抗菌覆盖范围。
感谢您关注并帮助传播bioRxiv的信息。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.05.08.723789v1?rss=1
🏷️ 裂解性噬菌体 多重耐药大肠杆菌 城市地表水 噬菌体分离鉴定 全基因组测序