胚・オルガノイド培養の研究ブログ | Adawarbler

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可吸入HUCMSC-Lipo仿生制剂抑制小鼠和非人灵长类肺纤维化模型中的成纤维细胞活化

肺纤维化（PF）是一种进行性且致命的肺部疾病，其发生由成纤维细胞异常激活和细胞外基质（ECM）过度沉积所驱动，进而导致肺部结构和功能逐渐衰退。现有疗法虽可延缓病情进展，却无法阻断纤维化重塑。在此，我们构建了一种可吸入仿生制剂 HUCMSC-Lipo，将人脐带间充质干细胞（HUCMSC）膜与人工磷脂融合，并采用贝叶斯优化（BO）框架对制剂参数进行系统优化，以确保其结构稳定性及雾化相容性。HUCMSC

PSI-NDH超复合体可防止低温诱导的PSI光抑制

2026/05/13

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植物学低温胁迫会在低温敏感型黄瓜中诱导光系统I（PSI）光抑制，其中叶绿体NADH脱氢酶样复合体（NDH）活性不足会导致PSI过度还原并受损。然而，这些发现是否能够推广到其他物种，以及NDH功能受损的分子机制是什么，仍尚不清楚。在本研究中，我们首先利用一个NDH缺陷型水稻突变体，考察了在低温胁迫下NDH是否对PSI保护至关重要。与野生型植株相比，NDH缺陷突变体在低温胁迫下表现出更强的PSI过度...

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DNA双链断裂信号传导诱导异常神经元活动

2026/05/13

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神经科学异常神经元活动是包括tau蛋白病在内的多种神经退行性疾病的早期病理特征，并被认为在疾病进展中发挥作用。然而，异常神经元活动的潜在机制仍不清楚。在此，我们揭示了DNA双链断裂（DSB）/p53通路激活与异常神经元活动之间的关系。通过诱导DSB激活作为DNA损伤应答一部分的p53，或通过阻止MDM2介导的p53降解，均可在小鼠和人类神经元中引发异常活动。p53激活诱导调控突触传递的基因表达，...

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2025年6月至7月秘鲁小美洲鸵暴发H9N2型禽流感病毒疫情

2026/05/13

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微生物学禽流感病毒（AIV）在美洲呈地方性流行，并导致家禽和野生鸟类暴发疫情，且偶尔会溢出感染人类。我们报道了秘鲁普诺地区小美洲鸵（Rhea pennata，亦称达尔文美洲鸵）中首例已知的AIV H9N2暴发。该研究中的动物生活在一处与外界隔离的保护中心，位于海拔4,000米以上的偏远高地。2025年6月至7月期间，共记录到92只动物中的46只发病，症状包括绿色腹泻（100%）、食欲减退（24%...

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脂质体相制备的可持续技术

2026/05/13

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药理学脂质体是由脂质自组装形成的囊泡，能够包封亲水性和疏水性治疗剂，因此成为药物递送和生物医学技术中的多功能平台。在本研究中，研究者对经典薄膜水化法的局限性进行了严格评估，并建立了一种可持续且经过系统优化的策略，用于生成明确的脂质体层状相。研究对水化条件进行了优化，确定每10 mg脂质加入4 mL缓冲液为最佳条件，可实现有效复水并提高囊泡测量的统计可靠性。经改进的探针超声方案（振幅20%，5 ...

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通过水热法和微波辅助法利用熊果提取物绿色合成荧光碳量子点：理化性质比较表征、抗氧化活性及生物相容性评价

2026/05/13

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生物化学具有可调表面化学性质和明确生物活性的光致发光纳米材料的可持续合成，仍然是绿色纳米科学中的核心挑战。本文表明，在对单一熊果提取物前驱体体系进行碳化时，所采用的能量输入路径会对所得碳量子点（CQDs）的表面化学、光学性能和生物活性产生决定性且机制一致的影响。水热处理（160°C，6 h）可得到水动力学直径为 7.13 nm 的颗粒，其表面富含羟基和羰基官能团，具有更高比例的石墨化碳（43.0...

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使用对比解码重新设计选择性蛋白质结合物

2026/05/13

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计算生物学动机：固定骨架序列设计方法，如 ProteinMPNN，仅基于骨架坐标进行操作，无法表征结合界面处目标分子的侧链。其解码算法也缺乏一种能够平衡结合亲和力与折叠稳定性，或提高对结构相似脱靶对象选择性的机制。这些缺陷限制了高亲和力和高特异性蛋白质结合体的计算设计。结果：我们提出了 RedNet，这是一种能够编码结合靶标侧链信息的多尺度图神经网络。我们进一步开发了一种对比解码算法，其灵感来...

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耻垢分枝杆菌中多功能 Spns 药物外排泵的质子偶联交替通路机制

2026/05/13

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生物化学 Spns 转运体属于主要易化子超家族蛋白，调控脂质转运、溶酶体稳态、免疫以及疾病过程，然而质子化如何使其能够执行化学性质多样的转运功能仍不清楚。在此，我们将脂质纳米盘中的双电子-电子共振光谱技术与 DEER 和 AlphaFold 引导的建模相结合，以界定……的构象图谱作者声明不存在竞争性利益关系。感谢您有兴趣传播有关 bioRxiv 的信息。 📄 原文链接： https://www...

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整合RNA测序分析鉴定出介导红豆杉属物种中紫杉烷外排的ABC转运蛋白

2026/05/13

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植物学来自药用红豆杉的RNA-seq数据集对于研究紫杉醇生物合成至关重要。然而，显著的批次效应阻碍了跨研究数据分析。在此，我们汇编了来自三项研究、涵盖四种组织（树皮、叶、根、茎）的45个RNA-seq样本，并评估了35种预处理流程，这些流程结合了六种归一化策略和五种批次效应校正方法。采用无监督聚类方法（HCA、k-means、Grade-of-Membership），并使用Jaccard指数和调...

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没有异源三聚体驱动蛋白的生命：锥虫类寄生虫利用同源二聚体驱动蛋白-2马达的组合来驱动鞭毛内运输

2026/05/13

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细胞生物学异源三聚体驱动蛋白2是顺向鞭毛内运输（IFT）的经典马达蛋白，驱动蛋白复合体向纤毛和鞭毛尖端移动。在此，我们表明，眼虫总门（Euglenozoa）的所有成员均缺失异源三聚体驱动蛋白基因，取而代之的是拥有数量可变的两类同源二聚体驱动蛋白基因，分别命名为KIN2A和KIN2B。当在体外表达时，布氏锥虫（Trypanosoma brucei）的这两种驱动蛋白均形成同源二聚体，并沿脑微管进行过...

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cran2crux：自动为 R 软件包创建 CRUX 移植包

2026/05/13

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生物信息学研究动机：R 连同 CRAN 和 Bioconductor 构成了生物信息学与计算生物学领域最丰富的生态系统之一，拥有数以千计的专用软件包。尽管 GNU/Linux 是该领域中广泛使用的操作系统，但 R 软件包通常独立于系统原生的软件包管理器进行管理。这种分离使得安装、更新和大规模重建变得繁琐。CRUX 是一个极简的半源码 GNU/Linux 发行版，凭借其基于 ports 的系统，为...

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HAIRpred2：利用混合物理化学与结构特征进行人类宿主特异性抗体相互作用残基预测

2026/05/13

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生物信息学构象性B细胞表位的预测对于疫苗设计、免疫治疗和抗体工程至关重要。迄今为止，已开发出若干与宿主无关的计算方法，用于预测抗原结构中与抗体相互作用的残基。然而，已有充分证据表明，抗原-抗体（Ag-Ab）相互作用会因宿主免疫系统的不同而发生变化，这表明开发宿主特异性预测模型具有重要意义。在本研究中，我们首次提出了一种人类宿主特异性方法HAIRpred2，可根据抗原的三级结构预测其中与抗体相互作...

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拟南芥中莽草酸途径分支点化合物分子——分支酸与异分支酸的周转揭示芳香族代谢的隐性动态

2026/05/13

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植物学莽草酸途径为植物初生代谢和次生代谢中的酚类代谢物提供前体。利用一种新型同位素异构体 MS/MS 方法，对完整拟南芥叶片中的碳通量进行测定，揭示了分枝酸与异分枝酸库之间出人意料的动态关系。13CO2 标记动力学表明，来源于叶绿体的莽草酸是一个主要的分流点，其中约三分之一从叶绿体转运出去。相比之下，分枝酸的小型代谢库主要定位于叶绿体内，并且周转迅速，在数分钟内标记率即超过 70%。异分枝酸作...

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