WEC技術前瞻 | 全胚胎旋转培养系统_WEC001-GT_Adawarbler

WEC技術前瞻

收割機上的擬桿菌目：基線流行率與丰度

2026年5月15日

0 275

微生物學新鮮農產品在生產和供應的各個階段都會接觸到病原體，而採收過程即為其中之一。為評估與採收相關的污染情況，我們對採收機1區表面進行了系統性拭子採樣，並採用定量聚合酶鏈式反應（qPCR）以擬桿菌目（Bacteroidales）作為糞便生物標誌物進行定量。基線污染以未檢出為主，偶爾在接近檢測限（LoD）的位置出現低水平檢出（<25拷貝/cm2）。採收後檢出更為頻繁（總體上採收前約為4%，採收後為...

CatIF-RL：通過引導式逆向蛋白質摺疊進行面向活性的酶序列設計

2026年5月15日

0 323

計算生物學蛋白質逆折疊模型旨在生成與給定骨架結構相容的氨基酸序列，但其並未被顯式優化用於特定生物學功能。在此，我們提出 CatIF-RL——一個引導基於圖的去噪擴散逆折疊模型設計具有增強催化活性的酶變體的框架。CatIF-RL 首先使逆折疊模型適配酶結構數據，隨後以預測催化常數（kcat）作為優化目標引入面向活性的偏好信號，並通過生成數據集篩選與組相對策略優化（GRPO）實現專門化。該過程通過迭...

丹麥軟腐果膠桿菌科概況：一項為期三年的田間採樣研究證明，不同地點的軟腐分離株中存在多個克隆支系，表明其具有共同來源

2026年5月15日

0 179

微生物學軟腐果膠桿菌科細菌（soft rot Pectobacteriaceae, SRP）是經濟上最重要的植物病原細菌之一，尤其以其在馬鈴薯生產中的危害而聞名。關於該病害傳播流行病學的研究已持續近一個世紀，並已有若干方面被強調為可能的感染途徑。然而，普遍認為該病害的主要來源是潛伏感染的母薯，但仍有若干參數會影響病害流行程度，包括受污染的設備、土壤水分狀況以及溫度。該病害的管理措施主要侷限於衛生...

電穿孔介導的蛋白質生物傳感器遞送用於分化肌管中的代謝成像

2026年5月15日

0 310

細胞生物學理解骨骼肌代謝需要對關鍵細胞參數進行即時監測，例如鈣離子（Ca2+）、三磷酸腺苷（ATP）、環磷酸腺苷（cAMP）以及細胞內溫度。基於熒光蛋白（FP）的生物傳感器被用於這些信號的活細胞成像，並具有較高的時空分辨率。分化後的肌管是用於生理性肌肉代謝研究的體外模型。然而，將基於FP的生物傳感器高效轉染至這些細胞中仍具有挑戰性。在此，我們開發了一種基於電穿孔的策略，用於將重組蛋白生物傳感器遞...

宏觀尺度行波連接狨猴發聲互動中的感知、反應選擇與發聲產生

2026年5月15日

0 267

神經科學發聲交流涉及一系列認知過程，這些過程大致可分為三個組成部分：感知交流信號；決定是否以及如何作出回應；以及生成發聲運動輸出。這些過程必須協調一致地運作，而各組成部分之間的整合與銜接對於實現有效交流至關重要。以往關於發聲交流的研究通常聚焦於特定腦區或孤立的認知功能，往往缺乏對宏觀尺度、全皮層動態及其在完整交流過程中的作用的整體視角。因此，儘管在人類中與各認知組成部分相關的皮層區域已經得到定位...

通過特徵學習對代謝網絡進行粗粒化揭示了跨物種生長規律

2026年5月15日

0 277

計算生物學細菌生長及其底層代謝網絡在不同物種之間存在高度差異，這對涉及多樣化物種的生物工程任務提出了根本性挑戰。對於特定物種而言，在不同營養環境下，生長通過蛋白質組分配進行調控，從而導致生長與粗粒化蛋白質組分區大小之間呈現線性關係。然而，這類粗粒化生長預測因子是否以及如何在物種間推廣，仍不清楚。在此，我們利用基因組尺度代謝模型，發現了一種簡單的跨物種趨勢：某一物種在單培養條件下的生長與其所利用的...

用於研究神經膠質相互作用的器官型新皮層切片培養

2026年5月15日

0 265

神經科學器官型切片培養（organotypic slice cultures, OSCs）被廣泛用於在具有功能性和發育性組織背景的條件下研究細胞特性。隨着近年來轉基因小鼠品系和病毒工具的出現，我們提出，OSCs 可能使研究發育過程以及穩態和病理條件下多細胞膠質細胞及神經膠質相互作用成為可能。在本研究中，我們製備了小鼠皮層 OSCs，並在體外培養第 1 至 28 天（days in vitro, ...

細胞內pH動態促進斑馬魚幼體尾部再生

2026年5月15日

0 259

細胞生物學細胞內pH（pHi）動態調控多種細胞行為，包括遷移和增殖。儘管這些功能已在線系細胞中得到充分證實，但pHi變化在體內的作用仍了解不足。我們構建了一種表達熒光比率型pHi生物傳感器的轉基因斑馬魚品系，並鑑定出斑馬魚幼體尾部再生過程中pHi的功能性變化。我們發現，尾部截除導致pHi短暫下降，隨後出現持續性的pHi升高，且高於截除前水平。此外，我們證明，通過藥理學方法抑制Na+/H+交換體（...

轉錄組與蛋白質組的單細胞同步分析

2026年5月15日

0 289

生物資訊學來自同一單細胞的轉錄組學和蛋白質組學測量提供了互補資訊，而這些資訊無法僅由任一單一模態推斷獲得。然而，從單細胞裂解液中並行回收這兩類分析物的方法仍然有限。在此，我們描述了一種工作流程：首先通過自動分配將單個細胞分離至最小化且與質譜兼容的裂解體積中，隨後依次進行mRNA捕獲和蛋白質上清液回收，再分別開展獨立的下游處理。該方法與標準文庫製備和數據非依賴採集蛋白質組學流程兼容，除單細胞分配平...

用於基因組預測中基因型-環境互作建模的新型矩陣乘法框架

2026年5月15日

0 269

計算生物學準確建模基因型×環境（GE）互作對於植物育種中的基因組預測至關重要，但由於其複雜的互作結構，這一任務仍然具有挑戰性。傳統模型通常採用基因型和環境協方差矩陣的Hadamard積來捕捉聯合相似性，但這可能無法充分表徵GE複雜性。本文提出一種新框架，通過基因型與環境核矩陣的矩陣乘法推導協方差結構，並將其分解為對稱分量，作為隨機效應納入混合模型中。該方法在11個小麥和水稻多環境數據集上進行評...

嘌呤能信號通過核鈣瞬變促進膠質瘤發生

2026年5月15日

0 281

醫學細胞內 Ca2+ 瞬變驅動關鍵的發育和生理過程，但其在腫瘤發生中的作用仍未完全闡明。在膠質母細胞瘤（GBM）這一侵襲性腦惡性腫瘤中，腫瘤細胞網絡表現出自我維持的 Ca2+ 瞬變，並通過尚不清楚的機制促進腫瘤生長。利用患者來源的 GBM 模型，我們發現這些瞬變主要依賴於細胞內 Ca2+ 儲庫，並可延伸至細胞核以驅動腫瘤發生。神經調節因子篩選鑑定出胞外嘌呤 ATP 和 ADP 可通過啟用代謝型嘌...

通過對小鼠和人類組織進行全面的小RNA亞硫酸氫鹽測序鑑定罕見的假尿苷化微RNA

2026年5月15日

0 274

分子生物學偽尿苷（Ψ）是許多非編碼RNA的重要轉錄後修飾，但由於歷史上偽尿苷定位方法的侷限性，miRNA中的該修飾一直缺乏充分表徵。Ψ修飾可穩定RNA雙鏈結構，因此可能在miRNA靶標結合與抑制中發揮重要作用。為探究哺乳動物miRNA被Ψ修飾的程度，我們採用亞硫酸氫鹽測序分析了人細胞和小鼠組織中短RNA（<30 nt）的修飾圖譜。我們的研究設計具備檢測小RNA偽尿苷化的能力，依據是對tRNA片段...

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成功案例集錦

在這裏我們將持續發佈儀器的使用案例和各種成功應用。

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